生物肥料的生產，由于一次性投資高達幾萬乃至上百萬元，一般個人難以承受，但只要掌握適當技術，投入極少的資金，采用土法同樣可制得較實用的生物肥料。下面介紹3種生產方式，供小型企業及農民朋友選擇時參考。

  　　一、固體型生物肥料生物肥料  
　　1.木粉生物肥：配方為：木屑1000千克，麥麩100千克，豆餅20千克，雞糞200千克，微生物復合菌液5千克。雞糞粉碎后，與木屑等全部拌勻，加水淋濕，使含水率約為55%～65%，建堆，每周翻一次，連續翻4～6次，晾干備用。生產要點：遮陰、防雨、防蟲。施用：用于高產出作物如大棚蔬菜作基肥時每個配方一次性施入，作追肥分3次溝施或穴施，隨即覆土，施入3天后再澆水。用于果樹，可挖穴施入。  
　　2.雞糞生物肥：配方為：雞糞1000千克，麥糠200千克，麥麩50千克，百益寶EM原液5-10千克。生產方法基本同上。施用：作基肥時每畝只需該配方的一半，作追肥時應分2～3次溝施條施，方法與上述相同。 
　　1.取普通發酵1000千克，麥麩50千克，紅糖10千克，玉米淀粉5千克，百益寶em原液2-3千克，加水約100千克左右，充分拌勻，建堆高1～1.2米，寬0.8～1米、長度不限，待堆溫升至45～50℃時翻堆，連翻5次堆，攤開晾干，包裝待用。施用量以每畝計：大棚蔬菜600千克，速生蔬菜1000千克，綠化草坪及花卉800千克。  
　　2.玉米秸、麥秸等（任何作物秸稈均可）5000千克，麥麩200千克，紅糖30千克，玉米淀粉30千克，百益寶EM原液10-15千克，秸稈可長可短，最好鍘至5～10厘米長，加水并共同拌勻后，建堆高1.5米、寬2～3米、長度不限，測料下30厘米溫度50～55℃時進行第一次翻堆，此后測料溫達最高峰時，維持10小時再翻堆，共翻堆6～8次，而后拌勻即可直接作基肥使用，也可晾干后貯存備用。一般每畝施入5000千克（濕重），并迅速翻入土壤，以防陽光直射殺死菌體。  
　　二、液體型生物肥料  
　　1.新鮮作物秸稈如青食玉米的秸稈、地瓜秧蔓或新鮮牧草以及鮮嫩雜草500千克，麥麩15千克，紅糖10千克，玉米淀粉5千克，黃豆粉2千克，過磷酸鈣12千克，百益寶em原液1-2千克。將秸稈或雜草鍘碎，共同混勻，置于深0.8～1米、約6立方溶積的水泥池中，也可臨時挖土坑墊塑膜應急使用。將混勻后的草料、原液等攤于池底，上覆1～2層遮陽網，再壓數根木棒，然后灌水至沒過草料30厘米左右，并將池沿進行遮陽處理。氣溫25℃以上時，數日后即有氣泡冒出水面，去掉水中覆蓋物后，用鐵叉類工具將草料等邊抖邊翻一次，繼續令其發菌。約20天后，即可取其菌液作追肥用。以每畝計，大棚蔬菜2000千克，速生蔬菜3000千克，大田作物1500千克，果樹1600千克，綠化草坪及花卉等2500千克。條施、穴施均可，注意壓土或者壓水，使肥液深入根際及其以下部位。  
　　2.取干雞糞5千克，麥麩2千克，豆餅粉1.8千克，紅糖0.5千克，淀粉0.2千克，水30千克，百益寶EM原液0.3-0.5千克。充分混勻后置于普通水缸類容器或小型水泥池，上覆遮陽網或草苫遮陽即可，注意每天攪拌1～2次以增氧。氣溫25℃時，10天即可使用。施用方法：將菌液稀釋，對入清水用于噴施：大棚菜300倍，速成蔬菜200倍，果樹150倍，其他作物120倍左右，草坪花卉等120倍，噴施操作同市面銷售生物肥料。  
　　三、追施型