保稅區倉庫主要業務如下：

一、發往國外貨物因品質或包裝退運，須返回工廠檢測或維修的;

二、機械設備，機電產品，電子產品，大宗原材料類產品，生產企業出口需要提前辦理退稅手續，或購買方為國內加工型企業;

三、保稅區內國際貨運代理業務。在保稅區可以開展國際貨運代理的業務,就象在保稅區外開展國際貨運代理業務一樣.

四、跨關區轉結深加工(轉廠)物流業務，保稅區與保稅物流區及倉庫的轉關業務:對于很多加工企業,因為核銷的緣故,必須先出口到保稅區,國內工廠再以手冊及一般貿易方式報進口關.而不是直接轉廠到最終收貨廠家,因為保稅的貨品轉廠手續麻煩.

五、國外批量進口，但生產商VMI管理的，需要分次不同時間段供貨;

六、進口設備或原材料，因許可證未辦理或購買客戶未確認等原因需要在港口滯留;

七、加工型企業因海關要求需要完成手冊核銷，但料件與成品需要轉結或退港的