綜合保稅區“保稅一日游”要追溯到區外的加工貿易。加工貿易在促進我國經濟發展上起到了重要作用，這在廣東等東南沿海地區尤甚，如被譽為“制造之都”的東莞市，就與加工貿易發展密切相關。

在加工貿易深加工結轉模式下，上游廠家成品即為下游廠家料件，通過深加工結轉延長加工鏈條，成品最終加工完畢后出口至國外。以珠三角為例，經過幾十年的培育發展，企業間配套協作密切，產業鏈契合度高，加工貿易企業之間貨物來往頻繁，但因為當時的貿易、稅收和監管等政策配套不足及各地監管聯動、手續復雜且人工作業效率低下等原因，深加工結轉存在諸多不便，于是產生“香港一日游”：加工貿易企業先將加貿成品出口到中國香港，以核銷手冊、獲取退稅后，再以加工貿易方式申報進口，貨物在保稅狀態下進入珠三角另外一家廠商進行下一道工序生產，但面臨作業周期長、手續復雜、運力浪費等難題。

隨著我國綜合保稅區、保稅物流園區、保稅物流中心（B型）等在全國落地開花，企業可以輕松利用特殊區域或保稅物流中心（B型）開展“保稅一日游”以代替“香港一日游”。